1. 高性能计算中心计算机群的配置如何?
高性能计算中心机群没有Windows系列的操作系统,使用的是CentOS Linux x86_64各版本的操作系统。请参考中心网站“平台资源”的“机群配置”了解各计算系统的软硬件配置信息。
2. 机群上有什么计算使用软件?
机群系统上安装有公用的编译器、函数库、作业调度系统以及部分免费开源的计算软件和部分商业计算软件。
已安装的软件可能含有多个版本,具体软件的调度使用,需要用户根据自身的使用需要设定软件调用的环境变量。
3. 高性能计算中心目前使用的计算网络是什么规格的?
有两种,一种是infiniband 40Gbps互联,另外一种是OPA 100Gbps互联。
4. 哪些人员可以申请计算帐号?
中心仅接受吉林大学在职在岗教师申请账号,暂不接受学生申请。
吉林大学校外人员申请前需电话联系高性能计算中心管理老师,咨询后决定是否可以申请。
5. 如何申请帐号及缴费?
申请帐号前需与中心老师联系确认资源情况,咨询后决定是否可以申请。
中心不接受现金缴费,只接受转账方式缴费。校内用户从QQ群JLU-HPCC (115060597)群共享或中心网站下载“高性能计算中心用户申请表”及缴费所需表格,按照表内的要求,填写完整后送到计算机楼B201。校外用户需填写“吉林大学高性能计算中心资源使用协议”,并将测试费用转入吉林大学暂存账户,到帐后中心完成入帐手续并开具发票。
6. 计算帐号的使用人员限制问题
已开通帐号仅限申请人个人使用,课题组内使用的公用计算帐号,应提供相应的专职联系人。
计算帐号不得私自借用,更不得私自借用于校外人员,一经发现,高性能计算中心有权直接停用该计算帐号,情节严重的将直接删除帐号,并上报学校追究相关人员责任。
所有联系负责人均应保证联系方式的畅通,在联系方式发生变化时,应及时告知高性能计算中心进行信息更新。
7. 计算帐号使用人的责任与义务问题
计算帐号所有使用者均应遵守国家相关法律法规、吉林大学校纪校规以及高性能计算中心制定的相关规定。在帐号使用过程中,发生的任何正常或非正常责任问题,均由申请人负责并承担。
计算帐号所有使用者均不得从事任何与高性能计算无关的操作,不得上传任何与计算无关的文件,发现的违规操作及文件,将给与警告并删除文件。
计算帐号使用人在使用本中心的计算支持产生科研成果后,应在发表论文、会议报告等时,对高性能计算中心的支持工作加以说明或表示致谢。
□ 本课题得到吉林大学高性能计算中心的支持。(Supported by High Performance Computing Center of Jilin University, China.)
□ 本课题经与吉林大学高性能计算中心合作完成。(Completed under cooperation between *** and High Performance Computing Center of Jilin University, China.)
8. 帐号登录是否有IP地址限制?
登录节点均设置了防火墙IP访问限制。
吉林大学校内IP地址可直接通过ssh方式远程登录。基于安全考虑,校内无线网络禁止登录。
9. 如何从校外登录系统
校外教育网IP来源可直接通过ssh方式远程登录。
使用校外非教育网IP地址登录时,吉林大学教职工用户可使用自己的邮箱帐号登录学校大数据和网络管理中心提供的VPN接入校内,详见http://vpn0.jlu.edu.cn/
用户不可自行修改密码,如有修改密码需求,请联系中心老师进行修改。
忘记登录密码:请QQ群JLU-HPCC (115060597)联系中心老师申请重置,需提供帐号名、所在服务器系统名称等必要信息。
用户不可为了方便记忆而设置简单密码,发现密码被窃取、帐号非正常登录等异常情况,应及时向高性能计算中心进行反馈。
11. 支持哪些数据传输种类
支持采用基于SSH协议的SFTP、SCP、RSYNC等加密传输数据,不支持FTP明文传输数据。
12. 计算节点可以登录吗?
登录节点和计算节点间做了网络隔离,用户无法登录计算结点。
13. workplace 目录是什么?不见了怎么办?
workplace目录是中心给用户创建的运行作业目录,用于提交计算作业。
请不要删除workplace。若误删了此目录,请用户及时跟中心老师联系,恢复此目录。
14. 请问可以给我 sudo(root) 权限吗?
root 或者 sudo 权限,任何情况下,都不会给用户。
15. 登录环境乱了,只显示 -bash-4.2$ 怎么办?
这是因为用户删除了 .bashrc 或者 .bash_profile 文件。可以从系统复制一份来恢复,退出,然后重新登录。
16. 能否提交下载数据类的脚本作业?
不能,计算节点都在内网,可以把需要的数据先下载下来,再计算。
17. windows下编写的代码,使用vim打开存在‘^M’,是什么原因?
Windows下换行标识和Unix不同,请使用dos2unix命令进行转换。
18. 用户文件的保存
1.用户帐号达到磁盘空间限额将无法上传、创建新的文件,请注意及时清理各自帐号的无用、陈旧文件。
2.用户帐号的目录文件夹下,不得上传保存任何与科研计算无关的文件。检查发现的非法文件,将被删除,并对用户给与警告,问题严重的将删除帐号并追究责任。
3.用户应注意及时下载备份各自的重要文件,高性能计算中心不提供任何文件的备份或恢复服务,亦无法保障用户的数据绝对安全。
19. “ls”等访问文件操作很慢
出现“ls”等访问文件夹操作慢的原因主要有3个:一是网络慢,网络延时大:二是有大量的I/O操作正在进行,造成I/O阻塞;三是该文件夹下的文件过多(有成千上万个文件)。若是原因一和二,通常等一段时间后即可恢复正常;若是原因三,则建议用户整理、清理一下自己的文件夹。